De StichtingZCL heeft 8 doelstellingen:
1 Een landelijk gespecialiseerd ziekenhuis voor chronische Lyme en persisterende infecties realiseren.
2 Een landelijke gespecialiseerd ziekenhuis voor chronische Lyme en persisterende infecties operationeel houden.
3 Meer kwaliteit van leven geven aan mensen met chronische Lyme en persisterende infecties.
4 Medische deskundigheid op één plek bundelen en het bevorderen van kennis t.a.v. chronische Lyme en persisterende infecties.
5 Samen met overheden, organisaties en bedrijven werken aan een betere medische behandeling en zorg bij chronische Lyme en persisterende infecties.
6 Vormgeven aan de re-integratie van mensen met chronische Lyme en persisterende infecties in de maatschappij, bij werkgevers en scholen.
7 Aan het sociale en maatschappelijke isolement een einde maken door de chronische Lyme, de persisteren infecties te behandelen.
8 De uitzichtloosheid en wanhoop stoppen bij chronische Lyme en persisterende infecties door mensen weer een toekomst te geven.